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    如何應(yīng)對細胞株系開發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)

    點擊次數(shù):1726 更新時間:2020-10-23

     

    細胞株開發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一。與任何篩選過程一樣,樣本通量帶來了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)。當(dāng)使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數(shù)據(jù)時,這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數(shù)據(jù),而且整個過程可能會延長數(shù)月。在整個過程中,必須對數(shù)據(jù)進行追蹤,以確保進入生產(chǎn)的任何細胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)(例如單克隆性的證明),并且為了報告需要,所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問。在這里,我們將描述在Biomek i7工作站(圖1)上自動化細胞株開發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。

     

    圖1:Biomek i7工作站與三方設(shè)備整合一起被用于自動化細胞株開發(fā)工作流程。

     

    作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分,Biomek軟件會自動移動數(shù)據(jù),因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動而并行移動(圖4)。同時,數(shù)據(jù)也可以存儲在DART數(shù)據(jù)庫中,未來任何時候掃描孔板條碼時,相應(yīng)的數(shù)據(jù)都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接(圖4)——在諸如細胞株開發(fā)這樣的長時間工作流程中,這是一個關(guān)鍵組件。

     

    圖3:自動化數(shù)據(jù)處理示意圖。

     

    除開存儲和利用數(shù)據(jù),DART數(shù)據(jù)庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進行快速可視化,可通過Chrome瀏覽器直接實時查看(圖6A),同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。

     

    圖6:DART數(shù)據(jù)查看和報告。

     

    在任何實驗中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)使實驗有價值。數(shù)據(jù)處理中的任何錯誤都可能消除這個價值,甚至可能將研究進程推向錯誤的方向。對于像細胞株開發(fā)這樣長達數(shù)月的工作流程,數(shù)據(jù)丟失或錯誤的風(fēng)險更大,因此,確保數(shù)據(jù)完整性的工具至關(guān)重要。Biomek和DART軟件通過使數(shù)據(jù)完整性過程自動化且易于獲取,可以為細胞株開發(fā)過程提供真正的價值。

     

    想要了解更多關(guān)于數(shù)據(jù)處理方面的內(nèi)容,請點擊下圖訪問貝克曼庫爾特生命科學(xué)部官|(zhì)網(wǎng)

     

     

    *以上內(nèi)容涉及設(shè)備僅適用于科研和工業(yè),不用于臨床診斷。

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