如何應對細胞株系開發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)

細胞株開發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一。與任何篩選過程一樣，樣本通量帶來了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)。當使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數(shù)據(jù)時，這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數(shù)據(jù)，而且整個過程可能會延長數(shù)月。在整個過程中，必須對數(shù)據(jù)進行追蹤，以確保進入生產(chǎn)的任何細胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)（例如單克隆性的證明），并且為了報告需要，所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問。在這里，我們將描述在Biomek i7工作站（圖1）上自動化細胞株開發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。

圖1：Biomek i7工作站與三方設備整合一起被用于自動化細胞株開發(fā)工作流程。

作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分，Biomek軟件會自動移動數(shù)據(jù)，因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動而并行移動（圖4）。同時，數(shù)據(jù)也可以存儲在DART數(shù)據(jù)庫中，未來任何時候掃描孔板條碼時，相應的數(shù)據(jù)都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接（圖4）——在諸如細胞株開發(fā)這樣的長時間工作流程中，這是一個關(guān)鍵組件。

圖3：自動化數(shù)據(jù)處理示意圖。

除開存儲和利用數(shù)據(jù)，DART數(shù)據(jù)庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進行快速可視化，可通過Chrome瀏覽器直接實時查看（圖6A），同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。

圖6：DART數(shù)據(jù)查看和報告。

在任何實驗中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)使實驗有價值。數(shù)據(jù)處理中的任何錯誤都可能消除這個價值，甚至可能將研究進程推向錯誤的方向。對于像細胞株開發(fā)這樣長達數(shù)月的工作流程，數(shù)據(jù)丟失或錯誤的風險更大，因此，確保數(shù)據(jù)完整性的工具至關(guān)重要。Biomek和DART軟件通過使數(shù)據(jù)完整性過程自動化且易于獲取，可以為細胞株開發(fā)過程提供真正的價值。

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*以上內(nèi)容涉及設備僅適用于科研和工業(yè)，不用于臨床診斷。